| |
|
|
| Registros recuperados : 17 | |
| 4. |  | MAGALHÃES, A. F. B.; LOBO, R. N. B.; FACO, O.; MORAIS, O. R. de; ALBUQUERQUE, F. H. M. A. R. de; SAMENTO, J. L. R. Estimativa de parâmetros genéticos para características de habilidade materna em ovinos da raça Somalis Brasileira. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 48., 2011, Belém. O desenvolvimento da produção animal e a responsabilidade frente a novos desafios: anais. Belém: SBZ, 2011. 3 f. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
|    |
| 5. | | MAGALHÃES, A. F. B.; LOBO, R. N. B.; FACO, O.; MORAIS, O. R. de; ALBUQUERQUE, F. H. M. A. R. de; SARMENTO, J. L. R. Estimativa de parâmetros genéticos para características reprodutivas em ovinos da raça Somalis Brasileira. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 21., 2011, Maceió. Inovações tecnológicas e mercado consumidor: anais. Maceió: Associação Brasileira de Zootecnistas, 2011. 3 f. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
| |
| 6. | | ALMEIDA, E. A. R.; PEREIRA, J. R.; CARVALHO, L. S.; SILVA, M. V. G. B.; MAGALHÃES, A. F. B.; VERARDO, L. L. Análises pós-estudo de associação no genoma de bovinos da raça Gir para a identificação de genes candidatos para perfil de ácidos graxos no leite. In: SIMPÓSIO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 7.; SIMPÓSIO DO PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO, 2.; SEMANA DA ZOOTECNIA, 15., 2023, Diamantina. Rumo ao futuro: [anais]. Diamantina: Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri, 2023. p. 36-38.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
| 7. | | CARVALHO, L. S.; ALMEIDA, E. A. R.; SOUZA, K. G. L. de; SILVA, M. V. G. B.; MAGALHÃES, A. F. B.; VERARDO, L. L. Análise funcional de genes candidatos associados à resistência ao carrapato em bovinos da raça Gir. In: SIMPÓSIO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 7.; SIMPÓSIO DO PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO, 2.; SEMANA DA ZOOTECNIA, 15., 2023, Diamantina. Rumo ao futuro: [anais]. Diamantina: Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri, 2023. p. 24-26.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
| 8. | | MAGALHÃES, A. F. B.; LOBO, R. N. B.; FACO, O.; MORAIS, O. R. de; ALBUQUERQUE, F. H. M. A. R. de; SARMENTO, J. L. R. Comparação de dois modelos estatísticos para uso do peso a desmama como critério de seleção em ovinos da raça Somalis Brasileira. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 21., 2011, Maceió. Inovações tecnológicas e mercado consumidor: anais. Maceió: Associação Brasileira de Zootecnistas, 2011. 3 f. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
| |
| 9. | | FERNANDES, A. A. S.; VIEIRA, J. I. G.; FERREIRA, P. H.; MAGALHÃES, A. F. B.; SILVA, M. V. G. B.; VERARDO, L. L. An insertion in Caracu breed genome with a possible role in fatty acids profile. In: REUNIÃO DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 57., 2022, Campinas. Tropical animal science and pratice to feed the planet: proceedings. Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Zootecnia; São Carlos, SP: Embrapa Pecuária Sudeste, 2022. p. 232.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
| 10. | | COSTA, E. I. S.; SIMEÃO, R. S. F.; MAGALHÃES, A. F. B.; ARAÚJO, J. F.; SOUSA, R. T. de; NASCIMENTO, E. N. do; ALBUQUERQUE, F. H. M. A. R. de; ROGÉRIO, M. C. P.; MARTINS, G. A. Estimativas de correlações entre os métodos, número de ovos por grama de fezes (OPG) e Famacha utilizados na identificação de helmintos em ovelhas Santa Inês e Morada Nova. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 1O.; ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO E PESQUISA, 3., 2008, Sobral. Anais... Sobral: Universidade Estadual Vale do Acaraú, 2008. 2 f. 1 CD ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
| |
| 11. | | SALES, C. M. P. V.; MAGALHÃES, A. F. B.; GOMES, G. L.; SIMEÃO, R. S. F.; N. JÚNIOR, P. S.; FARIAS, D. C.; MARTINS, G. A.; ALBUQUERQUE, F. H.; ROGÉRIO, M. C. P. Conhecimento da participação dos itens que geram despesas como fator determinante na condução de um sistema de produção de ovinos. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA UNIVERSIDADE ESTADUAL VALE DO ACARAÚ, 8., 2007, Sobral. Anais dos resumos. Sobral: Universidade Estadual Vale do Acaraú, 2007. p. 30.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
| |
| 12. | | MEMORIA, H. de Q.; MARTINS, G. A.; FRIDRICH, A. B.; ALBUQUERQUE, F. H. M. A. R.; ROGERIO, M. C. P.; MAGALHÃES, A. F. B.; NEVES, M. R. M.; ALBUQUERQUE, F. H. M. A. R. Fertilidade e prolificidade de ovinos criados em diferentes sistemas de produção na região Norte do Ceará. In: CONGRESSO NORDESTINO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 5.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE ALIMENTAÇÃO DE RUMINANTES, 11.; SIMPÓSIO SERGIPANO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 1., 2008, Aracaju. Anais... Aracaju: Sociedade Nordestina de Produção Animal; Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2008. 3 p.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
| |
| 13. | | SIMEÃO, R. S. F.; COSTA, E. I. S.; MAGALHÃES, A. F. B.; SOUSA, R. T. de; ARAÚJO, J. F.; MORENO, A. M. B.; ALBUQUERQUE, F. H. M. A. R. de; ROGÉRIO, M. C. P.; MARTINS, G. A. Diferenças genéticas e não genéticas que influenciam o escore corporal e estimativa da associação entre a condição corporal e o número de ovos por grama de fezes em ovelhas Morada Nova e Santa Inês. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 1O.; ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO E PESQUISA, 3., 2008, Sobral. Anais... Sobral: Universidade Estadual Vale do Acaraú, 2008. 2 f.1 CD ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
| |
| 14. | | TONUSSI, R. L.; SILVA, R. M. de O.; MAGALHAES, A. F. B.; ESPIGOLAN, R.; PERIPOLLI, E.; OLIVIERI, B. F.; FEITOSA, F. L. B.; LEMOS, M. V. A.; BERTON, M. P.; CHIAIA, H. L. J.; PEREIRA, A. S. C.; LOBO, R. B.; BEZERRA, L. A. F.; MAGNABOSCO, C. de U.; LOURENÇO, D. A. L.; AGUILAR, I.; BALDI REY, F. S. Application of single step genomic BLUP under different uncertain paternity scenarios using simulated data. PLoS ONE, v. 12, n. 9, e0181752, 28 September 2017.| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
| |
| 15. | | SANTOS, C. G. dos; SOUSA, M. F.; VIEIRA, J. I. G.; MORAIS, L. R. de; FERNANDES, A. A. S.; LITTIERE, T. de O.; OTTO, P. I.; MACHADO, M. A.; SILVA, M. V. G. B.; BONAFÉ, C. M.; MAGALHÃES, A. F. B.; VERARDO, L. L. Candidate genes for tick resistance in cattle: a systematic review combining post-GWAS analyses with sequencing data. Journal of Applied Animal Research, v. 50, n. 1, p. 460-470, 2022.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
| 16. | | VIEIRA, J. I. G.; BRAGA, L. G.; CHU, T. C. S.; FERREIRA, P. H.; GUIMARÃES, S. E. F.; MARTINS, M. F.; PANETTO, J. C. do C.; MACHADO, M. A.; SILVA, D. B. dos S.; BONAFÉ, C. M.; MAGALHÃES, A. F. B.; SILVA, M. V. G. B.; VERARDO, L. L. Resequencing of Brazilian locally adapted cattle breeds revealed variants in candidate genes and transcription factors for meat fatty acid profile. Journal of Animal Breeding and Genetics, 2024. First online.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
|  |
| 17. | | CARDOSO, D. F.; FERNANDES JÚNIOR, G. A.; SCALEZ, D. C. B.; ALVEZ, A. A. C.; MAGALHÃES, A. F. B.; BRESOLIN, T.; VENTURA, R. V.; LI, C.; OLIVEIRA, M. C. de S.; PORTO NETO, L. R.; CARVALHEIRO, R.; OLIVEIRA, H. N. de; TONHATI, H.; ALBUQUERQUE, L. G. Uncovering sub-structure and genomic profiles in across-countries subpopulations of Angus Cattle. Scientific Reports, v. 10, article 8770, 2020. 11 p.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
| |
| Registros recuperados : 17 | |
|
|
|
Registro Completo
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
|
Data corrente: |
08/12/2020 |
|
Data da última atualização: |
08/12/2020 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Circulação/Nível: |
A - 1 |
|
Autoria: |
CARDOSO, D. F.; FERNANDES JÚNIOR, G. A.; SCALEZ, D. C. B.; ALVEZ, A. A. C.; MAGALHÃES, A. F. B.; BRESOLIN, T.; VENTURA, R. V.; LI, C.; OLIVEIRA, M. C. de S.; PORTO NETO, L. R.; CARVALHEIRO, R.; OLIVEIRA, H. N. de; TONHATI, H.; ALBUQUERQUE, L. G. |
|
Afiliação: |
Diercles Francisco Cardoso, UNESP; Gerardo Alves Fernandes Júnior, UNESP; Daiane Cristina Becker Scalez, UNESP; Anderson Antonio Carvalho Alves, UNESP; Ana Fabrícia Braga Magalhães, UNESP; Tiago Bresolin, UNESP; Ricardo Vieira Ventura, USP; Changxi Li, University of Alberta; MARCIA CRISTINA DE SENA OLIVEIRA, CPPSE; Laercio Ribeiro Porto-Neto, CSIRO; Roberto Carvalheiro, UNESP; Henrique Nunes de Oliveira, UNESP; Humberto Tonhati, UNESP; Lucia Galvão Albuquerque, UNESP. |
|
Título: |
Uncovering sub-structure and genomic profiles in across-countries subpopulations of Angus Cattle. |
|
Ano de publicação: |
2020 |
|
Fonte/Imprenta: |
Scientific Reports, v. 10, article 8770, 2020. |
|
Páginas: |
11 p. |
|
DOI: |
https://doi.org/10.1038/s41598-020-65565-1 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
Highlighting genomic profiles for geographically distinct subpopulations of the same breed may provide insights into adaptation mechanisms to different environments, reveal genomic regions divergently selected, and offer initial guidance to joint genomic analysis. Here, we characterized similarities and differences between the genomic patterns of Angus subpopulations, born and raised in Canada (N?= 382) and Brazil (N = 566). Furthermore, we systematically scanned for selection signatures based on the detection of autozygosity islands common between the two subpopulations, and signals of divergent selection, via FST and varLD tests. The principal component analysis revealed a sub-structure with a close connection between the two subpopulations. The averages of genomic relationships, inbreeding coefficients, and linkage disequilibrium at varying genomic distances were rather similar across them, suggesting non-accentuated differences in overall genomic diversity. Autozygosity islands revealed selection signatures common to both subpopulations at chromosomes 13 (63.77?65.25 Mb) and 14 (22.81?23.57 Mb), which are notably known regions affecting growth traits. Nevertheless, further autozygosity islands along with FST and varLD tests unravel particular sites with accentuated population subdivision at BTAs 7 and 18 overlapping with known QTL and candidate genes of reproductive performance, thermoregulation, and resistance to infectious diseases. Our findings indicate overall genomic similarity between Angus subpopulations, with noticeable signals of divergent selection in genomic regions associated with the adaptation in different environments. MenosHighlighting genomic profiles for geographically distinct subpopulations of the same breed may provide insights into adaptation mechanisms to different environments, reveal genomic regions divergently selected, and offer initial guidance to joint genomic analysis. Here, we characterized similarities and differences between the genomic patterns of Angus subpopulations, born and raised in Canada (N?= 382) and Brazil (N = 566). Furthermore, we systematically scanned for selection signatures based on the detection of autozygosity islands common between the two subpopulations, and signals of divergent selection, via FST and varLD tests. The principal component analysis revealed a sub-structure with a close connection between the two subpopulations. The averages of genomic relationships, inbreeding coefficients, and linkage disequilibrium at varying genomic distances were rather similar across them, suggesting non-accentuated differences in overall genomic diversity. Autozygosity islands revealed selection signatures common to both subpopulations at chromosomes 13 (63.77?65.25 Mb) and 14 (22.81?23.57 Mb), which are notably known regions affecting growth traits. Nevertheless, further autozygosity islands along with FST and varLD tests unravel particular sites with accentuated population subdivision at BTAs 7 and 18 overlapping with known QTL and candidate genes of reproductive performance, thermoregulation, and resistance to infectious diseases. Our findings indicate overall genomi... Mostrar Tudo |
|
Palavras-Chave: |
Autozygosity islands; FST; Overall genomic diversity; Rather similar across; ROH islands; VarLD signals. |
|
Thesaurus NAL: |
Angus. |
|
Categoria do assunto: |
H Saúde e Patologia |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/218925/1/UncoveringSubStructure.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 02787naa a2200385 a 4500
001 2127803
005 2020-12-08
008 2020 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.1038/s41598-020-65565-1$2DOI
100 1 $aCARDOSO, D. F.
245 $aUncovering sub-structure and genomic profiles in across-countries subpopulations of Angus Cattle.$h[electronic resource]
260 $c2020
300 $a11 p.
520 $aHighlighting genomic profiles for geographically distinct subpopulations of the same breed may provide insights into adaptation mechanisms to different environments, reveal genomic regions divergently selected, and offer initial guidance to joint genomic analysis. Here, we characterized similarities and differences between the genomic patterns of Angus subpopulations, born and raised in Canada (N?= 382) and Brazil (N = 566). Furthermore, we systematically scanned for selection signatures based on the detection of autozygosity islands common between the two subpopulations, and signals of divergent selection, via FST and varLD tests. The principal component analysis revealed a sub-structure with a close connection between the two subpopulations. The averages of genomic relationships, inbreeding coefficients, and linkage disequilibrium at varying genomic distances were rather similar across them, suggesting non-accentuated differences in overall genomic diversity. Autozygosity islands revealed selection signatures common to both subpopulations at chromosomes 13 (63.77?65.25 Mb) and 14 (22.81?23.57 Mb), which are notably known regions affecting growth traits. Nevertheless, further autozygosity islands along with FST and varLD tests unravel particular sites with accentuated population subdivision at BTAs 7 and 18 overlapping with known QTL and candidate genes of reproductive performance, thermoregulation, and resistance to infectious diseases. Our findings indicate overall genomic similarity between Angus subpopulations, with noticeable signals of divergent selection in genomic regions associated with the adaptation in different environments.
650 $aAngus
653 $aAutozygosity islands
653 $aFST
653 $aOverall genomic diversity
653 $aRather similar across
653 $aROH islands
653 $aVarLD signals
700 1 $aFERNANDES JÚNIOR, G. A.
700 1 $aSCALEZ, D. C. B.
700 1 $aALVEZ, A. A. C.
700 1 $aMAGALHÃES, A. F. B.
700 1 $aBRESOLIN, T.
700 1 $aVENTURA, R. V.
700 1 $aLI, C.
700 1 $aOLIVEIRA, M. C. de S.
700 1 $aPORTO NETO, L. R.
700 1 $aCARVALHEIRO, R.
700 1 $aOLIVEIRA, H. N. de
700 1 $aTONHATI, H.
700 1 $aALBUQUERQUE, L. G.
773 $tScientific Reports$gv. 10, article 8770, 2020.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
